A principal diferença entre whey concentrado e isolado é a concentração de proteína e a quantidade de carboidratos, gorduras e lactose presentes em cada forma. O whey concentrado contém cerca de 70-80% de proteína e quantidades variáveis de carboidratos, gorduras e lactose, enquanto o whey isolado contém até 90% de proteína e é livre de carboidratos, gorduras e lactose.